Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL27AP46776 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms