Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN1BP46527 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms