Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA4P43681 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA4P43681 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms