Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A4P43007 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms