Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC19A1P41440 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC19A1P41440 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms