Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA4P41247 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA4P41247 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms