Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARL1P40616 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARL1P40616 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL1P40616 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL1P40616 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL1P40616 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL1P40616 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL1P40616 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms