Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THPOP40225 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THPOP40225 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THPOP40225 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THPOP40225 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THPOP40225 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THPOP40225 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THPOP40225 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THPOP40225 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THPOP40225 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THPOP40225 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THPOP40225 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THPOP40225 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THPOP40225 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
THPOP40225 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THPOP40225 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THPOP40225 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THPOP40225 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THPOP40225 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THPOP40225 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THPOP40225 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THPOP40225 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THPOP40225 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THPOP40225 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THPOP40225 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THPOP40225 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THPOP40225 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THPOP40225 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THPOP40225 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THPOP40225 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms