Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt7.64□□□□□ -1.19
SSP1P38871 CKA2YOR061W 1020 nt7.64□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YAH1YPL252C 519 nt7.64□□□□□ -1.19
SSP1P38871 SUS1YBR111W-A 291 nt7.64□□□□□ -1.19
SSP1P38871 ERG1YGR175C 1491 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 RMD8YFR048W 1989 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 HNT1YDL125C 477 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 MAK16YAL025C 921 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 ATG10YLL042C 504 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 RIO2YNL207W 1278 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YPR098CYPR098C 486 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YPT10YBR264C 600 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 VBA5YKR105C 1749 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 POB3YML069W 1659 nt7.63□□□□□ -1.19
SSP1P38871 PAM1YDR251W 2493 nt7.62□□□□□ -1.19
SSP1P38871 EXO5YBR163W 1758 nt7.62□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YER148W-AYER148W-A 579 nt7.62□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YGL193CYGL193C 312 nt7.62□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YGR035CYGR035C 351 nt7.62□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YJR079WYJR079W 330 nt7.62□□□□□ -1.19
SSP1P38871 COX17YLL009C 210 nt7.62□□□□□ -1.19
SSP1P38871 ARG80YMR042W 534 nt7.62□□□□□ -1.19
SSP1P38871 AQR1YNL065W 1761 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 AFG3YER017C 2286 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 OAR1YKL055C 837 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YKL147CYKL147C 618 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 CDC42YLR229C 576 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YML031C-AYML031C-A 336 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 POP3YNL282W 588 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 DSC3YOR223W 879 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 PHO85YPL031C 918 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 VPS69YPR087W 321 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YPR174CYPR174C 666 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 AIM4YBR194W 372 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 TOD6YBL054W 1578 nt7.61□□□□□ -1.19
SSP1P38871 VHR1YIL056W 1923 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 HSP82YPL240C 2130 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YDR327WYDR327W 327 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 Q0143Q0143 153 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 LAG1YHL003C 1236 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YKL044WYKL044W 321 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YOR203WYOR203W 354 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 HPA2YPR193C 471 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 CAN1YEL063C 1773 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 VNX1YNL321W 2727 nt7.6□□□□□ -1.19
SSP1P38871 HAA1YPR008W 2085 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 MRM2YGL136C 963 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 DAD2YKR083C 402 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 YMR320WYMR320W 306 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 RPS3YNL178W 723 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 NSL1YPL233W 651 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 ACO1YLR304C 2337 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 NTH1YDR001C 2256 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 SER33YIL074C 1410 nt7.59□□□□□ -1.19
SSP1P38871 ADE12YNL220W 1302 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 TKL1YPR074C 2043 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 ENB1YOL158C 1821 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 NHP2YDL208W 471 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YDR413CYDR413C 576 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 PIL1YGR086C 1020 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YOR379CYOR379C 339 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YJR098CYJR098C 1971 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 CDC55YGL190C 1581 nt7.58□□□□□ -1.2
SSP1P38871 PAL1YDR348C 1500 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 PGI1YBR196C 1665 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 SRD1YCR018C 666 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YPT32YGL210W 669 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 PHO86YJL117W 936 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YJR012CYJR012C 624 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 RUF23RUF23 254 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 RPL18BYNL301C 561 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YOL134CYOL134C 390 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YBR284WYBR284W 2394 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 ANR2YKL047W 1551 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 SWT1YOR166C 1377 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 AFG1YEL052W 1530 nt7.57□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YBR241CYBR241C 1467 nt7.56□□□□□ -1.2
SSP1P38871 TFB3YDR460W 966 nt7.56□□□□□ -1.2
SSP1P38871 GRX2YDR513W 432 nt7.56□□□□□ -1.2
SSP1P38871 CBR1YIL043C 855 nt7.56□□□□□ -1.2
SSP1P38871 AFB1YLR040C 675 nt7.56□□□□□ -1.2
SSP1P38871 VMA13YPR036W 1437 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YCR090CYCR090C 549 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 SKP1YDR328C 585 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YDR417CYDR417C 372 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 SAE2YGL175C 1038 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 RPL17BYJL177W 555 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 ATG36YJL185C 882 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 COX8YLR395C 237 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 MDG1YNL173C 1101 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 YOR277CYOR277C 309 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 UBP6YFR010W 1500 nt7.55□□□□□ -1.2
SSP1P38871 RBA50YDR527W 1320 nt7.54□□□□□ -1.2
SSP1P38871 ASI3YNL008C 2031 nt7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.5 ms