Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms