Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP2P32456 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBP2P32456 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBP2P32456 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBP2P32456 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP2P32456 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP2P32456 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms