Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms