Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXC12P31275 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms