Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP1P29466 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP1P29466 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP1P29466 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP1P29466 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP1P29466 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP1P29466 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP1P29466 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP1P29466 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP1P29466 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP1P29466 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP1P29466 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP1P29466 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP1P29466 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP1P29466 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP1P29466 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP1P29466 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms