Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID4AP29374 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms