Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB2P29033 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB2P29033 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB2P29033 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB2P29033 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB2P29033 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB2P29033 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB2P29033 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB2P29033 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB2P29033 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB2P29033 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB2P29033 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB2P29033 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB2P29033 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB2P29033 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB2P29033 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB2P29033 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB2P29033 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB2P29033 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB2P29033 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB2P29033 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB2P29033 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB2P29033 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB2P29033 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB2P29033 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB2P29033 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB2P29033 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB2P29033 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB2P29033 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB2P29033 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB2P29033 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB2P29033 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB2P29033 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB2P29033 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB2P29033 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB2P29033 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB2P29033 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms