Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms