Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX2P28328 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX2P28328 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX2P28328 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX2P28328 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX2P28328 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX2P28328 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX2P28328 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX2P28328 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PEX2P28328 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX2P28328 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX2P28328 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX2P28328 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PEX2P28328 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms