Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSFA2P28290 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms