Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA4P25789 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA4P25789 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms