Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSSP25774 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSSP25774 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSSP25774 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSSP25774 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSSP25774 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSSP25774 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSSP25774 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSSP25774 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSSP25774 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSSP25774 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSSP25774 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTSSP25774 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms