Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACO1P21399 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACO1P21399 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ACO1P21399 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACO1P21399 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACO1P21399 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACO1P21399 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACO1P21399 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACO1P21399 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACO1P21399 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACO1P21399 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACO1P21399 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACO1P21399 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACO1P21399 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACO1P21399 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACO1P21399 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms