Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCP20941 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCP20941 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCP20941 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCP20941 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCP20941 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCP20941 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCP20941 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCP20941 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCP20941 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms