Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms