Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRHP20396 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRHP20396 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRHP20396 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TRHP20396 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRHP20396 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRHP20396 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRHP20396 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRHP20396 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRHP20396 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRHP20396 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRHP20396 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRHP20396 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRHP20396 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRHP20396 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRHP20396 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TRHP20396 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRHP20396 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRHP20396 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRHP20396 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TRHP20396 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRHP20396 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRHP20396 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRHP20396 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRHP20396 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRHP20396 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRHP20396 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRHP20396 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRHP20396 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRHP20396 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRHP20396 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRHP20396 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRHP20396 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRHP20396 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRHP20396 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TRHP20396 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRHP20396 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRHP20396 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TRHP20396 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRHP20396 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRHP20396 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRHP20396 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRHP20396 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRHP20396 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRHP20396 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRHP20396 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRHP20396 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRHP20396 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRHP20396 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRHP20396 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRHP20396 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRHP20396 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRHP20396 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRHP20396 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRHP20396 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRHP20396 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRHP20396 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRHP20396 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 278.7 ms