Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERCC3P19447 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms