Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCAM1P19320 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms