Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSPAN8P19075 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms