Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6P18850 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6P18850 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6P18850 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF6P18850 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6P18850 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6P18850 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6P18850 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6P18850 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6P18850 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6P18850 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6P18850 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6P18850 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6P18850 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6P18850 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6P18850 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6P18850 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6P18850 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6P18850 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6P18850 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6P18850 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6P18850 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms