Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN1P18031 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms