Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA3P15088 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA3P15088 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA3P15088 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA3P15088 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPA3P15088 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPA3P15088 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPA3P15088 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPA3P15088 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CPA3P15088 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CPA3P15088 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPA3P15088 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPA3P15088 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPA3P15088 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPA3P15088 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPA3P15088 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPA3P15088 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms