Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM27P14373 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM27P14373 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM27P14373 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TRIM27P14373 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM27P14373 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms