Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCP1P13796 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCP1P13796 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCP1P13796 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCP1P13796 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCP1P13796 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCP1P13796 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCP1P13796 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCP1P13796 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCP1P13796 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms