Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMP2P13473 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMP2P13473 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms