Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms