Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RLBP1P12271 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RLBP1P12271 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RLBP1P12271 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RLBP1P12271 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RLBP1P12271 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RLBP1P12271 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLBP1P12271 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms