Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VPREB1P12018 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms