Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMP1P11279 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMP1P11279 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms