Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNB1P11230 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms