Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
LAMC1P11047 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LAMC1P11047 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMC1P11047 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms