Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HKR1P10072 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HKR1P10072 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HKR1P10072 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HKR1P10072 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HKR1P10072 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms