Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms