Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM200BP0CF97 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms