Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRR29P0C7W0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR29P0C7W0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms