Protein–RNA interactions for Protein: P09564

CD7, T-cell antigen CD7, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD7P09564 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD7P09564 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD7P09564 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD7P09564 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD7P09564 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD7P09564 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD7P09564 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD7P09564 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD7P09564 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD7P09564 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD7P09564 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD7P09564 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD7P09564 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms