Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIL1P09327 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VIL1P09327 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIL1P09327 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIL1P09327 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIL1P09327 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIL1P09327 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIL1P09327 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIL1P09327 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIL1P09327 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIL1P09327 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIL1P09327 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIL1P09327 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIL1P09327 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIL1P09327 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIL1P09327 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIL1P09327 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIL1P09327 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIL1P09327 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIL1P09327 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIL1P09327 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIL1P09327 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIL1P09327 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIL1P09327 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIL1P09327 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VIL1P09327 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIL1P09327 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIL1P09327 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIL1P09327 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIL1P09327 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIL1P09327 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIL1P09327 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIL1P09327 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIL1P09327 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIL1P09327 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIL1P09327 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIL1P09327 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIL1P09327 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIL1P09327 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIL1P09327 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIL1P09327 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VIL1P09327 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VIL1P09327 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VIL1P09327 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VIL1P09327 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VIL1P09327 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VIL1P09327 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VIL1P09327 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms