Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms