Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCGP05129 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms