Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL10P02778 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL10P02778 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms