Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGGP02679 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGGP02679 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGGP02679 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGGP02679 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGGP02679 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGGP02679 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGGP02679 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGGP02679 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGGP02679 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGGP02679 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGGP02679 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGGP02679 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGGP02679 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGGP02679 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms